故事发生在东京八丈岛近海，一座将全球各地警方监控相连接的高科技设施——“太平洋浮标”即将启动。为了与欧洲刑警组织管辖的范围联网，来自世界各地的工程师聚集在这里。基于人脸识别的全新“黑科技”也正在测试中…ccc
与此同时，柯南一行人前往八丈岛观鲸，途中柯南接到冲矢昴（赤井秀一）的电话，被告知欧洲刑警组织成员在德国遭到琴酒的杀害。为调查真相的柯南潜入“太平洋浮标”。正当工程师们正在为系统启动而展开准备工作时，一桩案件突然发生！一名女工程师被黑暗组织绑架，她手中存有核心技术的U盘也落入了黑暗组织手中！
此时，水下传来未知潜水艇逼近的声音，令人毛骨悚然，一个神秘的黑影也正在悄悄接近灰原哀……
梶原岳人,日高里菜,白石晴香,广濑大介,梅原裕一郎,木村良平,石川由依,真野美月,七濑彩夏,大木咲绘子,增田俊树,大森日雅,井上麻里奈
武内骏辅,佐伯伊织,上田瞳,白石晴香
富田凉介,坂泰斗,远藤大智,永冢拓马,依田菜津,池泽春菜,橘龙丸,古川慎,若山诗音,永濑安奈
阿部敦,福圆美里,种崎敦美,山冈百合,藤田茜,山本和臣,杉田智和,新井里美,武田华
井上穗乃花,中村绫,松本保典,宫濑尚也,宫本侑芽
高山南,石见舞菜香,细谷佳正